Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF22A3QJZ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms