Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPDC1A2A3K4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms