Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA6A0AVT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms