Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF3AQ9Y496 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms