Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms