Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms