Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms