Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms