Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.8 ms