Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAE1Q9UBE0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms