Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms