Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRD1Q9P1U0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms