Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf78Q9NZ63 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms