Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR4Q9NYA4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTMR4Q9NYA4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms