Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D2Q9NY47 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms