Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms