Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDIT4Q9NX09 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms