Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATG3Q9NT62 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms