Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGAP3Q9NP61 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms