Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms