Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms