Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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FOXQ1Q9C009 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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FOXQ1Q9C009 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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FOXQ1Q9C009 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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FOXQ1Q9C009 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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FOXQ1Q9C009 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXQ1Q9C009 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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