Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM31Q9BZY9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms