Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms