Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms