Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms