Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms