Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms