Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmed9Q99KF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms