Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF6Q99612 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms