Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT140Q96RY7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT140Q96RY7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms