Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC6Q96NY7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms