Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227BQ96M60 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms