Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPGRIP1Q96KN7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms