Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
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