Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAP3Q96FM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGAP3Q96FM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms