Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB2Q96DC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUB2Q96DC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB2Q96DC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB2Q96DC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.6 ms