Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCC1Q96CN9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms