Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4CQ96CF2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4CQ96CF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms