Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms