Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms