Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms