Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATJQ8NI35 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATJQ8NI35 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms