Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD1Q8NHV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms