Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF548Q8NEK5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms