Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms