Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSIG10Q8N0Z9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms