Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms