Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD4Q7Z3J3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms