Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp3Q7TNH6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms